Zdaniem bydgoskiego radnego prof. Macieja Świątkowskiego, w przeszłości pracownika Collegium Medicum, a także członka NSZZ Solidarność w CM, winę za to ponosi polityka rektora UMK - CM nie otrzymało żadnych pieniędzy na zakup aparatury badawczej ze środków UE w okresie przedakcesyjnym oraz w perspektywie finansowej 2007 – 2013 w przeciwieństwie do toruńskiego kampusu (ICNT, Collegium Humanisticum) – pisze prof. Świątkowski - kierując się często nieetycznymi rozgrywkami personalnymi władze rektorskie UMK na własne życzenie stworzyły trudności i nieprawidłowości w pozyskaniu dla CM aparatury badawczej z udziałem środków z EU z KT dla województwa Kujawsko – Pomorskiego w perspektywie finansowej 2014 – 2020. Do dnia dzisiejszego a mamy już środek 2019 roku żadna jednostka CM UMK nie otrzymała jeszcze aparatury badawczej u udziałem finansów pochodzących z KT.

Zdaniem prof. Macieja Świątkowskiego Collegium Medicum przy takim zarządzaniu staje się wyższą szkołą zawodową - Nie będzie także rozwoju CM w ramach UMK dopóki Rektorzy UMK będą mianowali na stanowiska kierownicze prorektora/ów i dziekanów CM osoby wg zasady: BMW czyli Bierny, Mierny ale Wierny. Fałszywie rozumiana lojalność zarządzających CM wobec Rektora UMK niszczy uczelnie medyczną w Bydgoszczy ponieważ prowadzi do pozbawiania pracy często kreatywnych ale niewygodnych Rektorowi osób. W naszej ocenie praktycznie zmierzamy do poziomu wyższej medycznej szkoły zawodowej. Rektor UMK za taki sposób zarządzania CM przez swoich nominatów potrafi również ich wynagradzać. Z informacji pozyskanych z Urzędu Marszałkowskiego wynika, że w ramach realizacji projektu z KT dla Woj. Kuj. – Pom. pt.: „Bezpieczeństwo łańcucha żywnościowego i żywność spersonalizowane” beneficjentem finansowym będą jednostki zlokalizowane nie w Szpitalu Uniwersyteckim nr 2 a w Szpitalu Uniwersyteckim nr 1 i tak: najnowszej generacji aparaturę badawczą dla oceny lipidów u człowieka ma otrzymać Katedra kierowana przez Panią prof. Grażynę Odrowąż – Sypniewską Prorektor UMK ds. CM a pozostałe i to znaczące środki ma otrzymać Zakład, który kieruje żona Pana prof. Jacka Kubicy Prorektora UMK ds. Nauki Pani Aldona Kubica.

Profesor Świątkowski należy do zwolenników utworzenia na bazie Collegium Medicum, niezależnego od UMK w Toruniu, Uniwersytetu Medycznego w Bydgoszczy. Komisje sejmowe zajmujące się obywatelskim projektem utworzenia uczelni medycznej w Bydgoszczy, rekomendują jego odrzucenie przez Sejm. Projekt od kilku miesięcy czeka na rozpatrzenie na posiedzeniu plenarnym i wszystko na to wskazuje, że raczej przed wyborami parlamentarnymi to nie nastąpi.