Niemiecka propaganda próbowała przedstawiać wydarzenia z 3 i 4 września jako czystki na mniejszości niemieckiej, był to pretekst do masowych egzekucji na Polakach i Żydach, którzy w pierwszej kolejności byli dla Niemców niewygodni, później eksterminowano także elity w tym nauczycieli.

O ofiarach tamtego okresu pamiętano w środę zarówno podczas uroczystości na płycie Starego Rynku, gdzie Pomnik Walki i Męczeństwa przypomina o tamtych wydarzeniach – Stary Rynek wpisał się bowiem też jako miejsce masowych egzekucji. Pamiętano również na Cmentarzu Bohaterów Bydgoszczy, gdzie spoczywają ofiary jesienie 1939 roku, znajduje się tam też symboliczny grób zamordowanego najprawdopodobniej 11 listopada 1939 roku prezydenta Bydgoszczy Leona Barciszewskiego. Jego szczątek nie odnaleziono do dziś.