Większościowym udziałowcem w Porcie Lotniczym Bydgoszcz jest Województwo Kujawsko-Pomorskie posiadające ponad 72% udziałów, wśród mniejszościowych udziałowców najwięcej – ponad 22% udziałów ma Miasto Bydgoszcz. Ta struktura podziału udziałów może ulec jednak wkrótce zmianie.
We wrześniu Sejmik Województwa wyraził zgodę na objęcie przez Województwo kolejnych akcji o wartości 12 mln zł, w celu zabezpieczenia środków na funkcjonowanie lotniska w 2020 i 2021 roku, bowiem pandemia COVID-19 w sposób szczególny uderza w branżę lotniczą. Do dzisiaj działań w kierunku dokapitalizowania Portu Lotniczego nie podjęło Miasto Bydgoszcz. Nieoficjalnie ustalamy, że raczej na taki krok póki co się nie zanosi. Zwróciliśmy się również do Urzędu Miasta Bydgoszczy z oficjalnym zapytaniem.
Zakładając, że Bydgoszcz nie dokapitalizuje lotniska, wówczas udziały Województwa Kujawsko-Pomorskiego przekroczą 75%, natomiast Miasta Bydgoszczy spadną do 20,1%.
