Adrian Małachowski przygodę z piłką nożną rozpoczynał w Zawiszy, jako młody adept piłkarski urodzony w Bydgoszczy. Później trafił do juniorów Legii Warszawa, tego lata został kupiony przez 3 ligowy 1. FC Magdeburg. Małachowski występuje głównie na pozycji defensywnego pomocnika.
1. FC Magdeburg to jedna z bardziej utytułowanych niemieckich zespołów, z występami w pucharach europejskich. W 1974 roku FC Magdeburg zdobył europejski Puchar Zdobywców Pucharów. Po zjednoczeniu Niemiec klub występuje już w niższych ligach.
Adrian Małachowski po epizodzie w Legii (nigdy nie zagrał w pierwszym składzie) trafił do Pogoni Siedlce, a następnie do Znicza Pruszków. W sezonie 2019/2020 reprezentował barwy I ligowego GKS-u Bełchatów, zdobywając dwie brami oraz przyczyniając się do dwóch kolejnych asystując. Ostatnio przeszedł do niemieckiego 1. FC Magdeburg.
Małachowski zadebiutował również w juniorskich reprezentacjach U-17 i U-18.
