Żółte tło kojarzy się dużej mierze kibiców piłkarskich negatywnie, takiego znaku używał bowiem kilka lat temu przeniesiony do Bydgoszczy II ligowy Kujawiak Włocławek, który zmienił nazwę na Zawiszę. Po kilku miesiącach obecności klub został wycofany z powodu umoczenia w aferę korupcyjną. Istnieje zatem duże prawdopodobieństwo, że nowego znaku nie zaakceptuje kibicowska Polska.

Właścicielowi klubu Radosławowi Osuchowi chodzi zapewne jednak o prawa do znaku. Obecnie używany herb jest własnością Stowarzyszenia Piłkarskiego ,,Zawisza”, które jest bezpłatnie użyczane klubowi WKS Zawisza Bydgoszcz SA, którego stowarzyszenie jest mniejszościowym udziałowcem. W ostatnim czasie miało dochodzić jednak do sporów pomiędzy udziałowcami o to, że stowarzyszenie nie jest nawet informowane w jaki sposób prawa do herbu są użyczane przez klub. Taka sytuacja miała mieć chociażby w przypadku wyrażenia licencji na wykorzystanie go w grze Fifa 14.