Dworzec PKS znajduje się kilka kilometrów od stacji Bydgoszcz Główna, co jest rozwiązaniem niezbyt funkcjonalnym. Zazwyczaj dworce powstają obok siebie, aby umożliwić podróżnemu sprawną przesiadkę. W przypadku Bydgoszczy konieczny jest przejazd przez sporą część miasta tramwajem.