Problemu Nitro-Chemu rozpoczęły się po upadku Zachemu, gdyż był to główny dostarczyciel nieczystości przemysłowych do Spółki Wodnej ,,Kapuściska”. Z tego też powodu spółka ta chcąc utrzymać rentowność zdecydowała się podwyższyć kilkukrotnie wysokość opłat za ścieki, co z kolei stało się zagrożeniem dla dalszego bytu Nitro-Chemu i doprowadziło do sporu przedsiębiorcy z głównym właścicielem Spółki Wodnej ,,Kapuściska” miastem Bydgoszczą. Ratusz wysokie stawki z kolei tłumaczył faktem, że nie może obarczać mieszkańców kosztami oczyszczania ścieków przemysłowych.
Ten problem może być rozwiązany dzięki dotacji przekazanej przez Ministerstwo Skarbu Państwa. W podpisaniu piątkowej umowy uczestniczyła posłanka Iwona Kozłowska, która na bieżąco zajmowała się problematyką Nitro-Chemu. Przedsiebiorstwo to mogło liczyć na szczególną życzliwość rządu z tego powodu, iż jest ważnym ogniwem polskiego przemysłu zbrojeniowego.