Wiele szpitali powiatowych ma problemy finansowe, bydgoski Szpital Miejski do nich się nie zalicza, bowiem jak wynika z przyjętego w czerwcu przez prezydenta sprawozdania finansowego, rok 2021 zakończył ponad pół milionowym zyskiem. Również rok 2020 zamknięty był z zyskiem powyżej pół miliona. W 2021 roku zysk udało się poprawić o ponad 60 tys. zł.
Ze sprawozdania wynika też, że bydgoski szpital nie posiada specjalnie istotnych zobowiązań. Rok 2021 był rekordowy jeżeli chodzi o przychody z działalności leczniczej , które przekroczyły 100 mln zł. Również rekordowe były koszty operacyjne, ale przyniosło to zysk w kwocie blisko 668 tys. zł, po zapłaceniu od tej kwoty ponad 102 tys. zł podatku, Wielospecjalistyczny Szpital Miejski kończy rok z ponad 565 tys. zyskiem. Całość zobowiązań długoterminowych szpitala na 31 grudnia 2021 roku oszacowano na 149,4 tys. zł, czyli jest to kilkukrotnie mniejsza kwota od wypracowanego w roku ubiegłym zysku.
Szpital Miejski nie odgrywał specjalnej roli w czasie pandemii COVID-19 – choć takimi pacjentami także się zajmował, wiele placówek które taką rolę odgrywały, dzięki dodatkom COVID-19 mogły znacznie poprawić swoje finanse.