Pod RZGW Bydgoszcz podlegają dwa zarządy zlewni: w Inowrocławiu i w Pile.
Na czele RZGW w Bydgoszczy powołany został w ubiegłym tygodniu Piotr Kurnatowski, który w pracy wokół ochrony środowiska i gospodarki wodnej ma około 25 lat doświadczenia. Przez ostatnie lata był kierownikiem w Zarządzie Zlewni w Inowrocławiu podległemu bydgoskiemu RZGW. Piotr Kurnatowski jest tez aktywnym działaczem politycznym PSL.
Za poprzedniego rządu w RZGW w Bydgoszczy na kierowniczych stanowiskach znajdowały się osoby związane z PiS-em.