Bydgoska strona wywiązała się w pełni z założeń określonych przez Ministerstwo Infrastruktury i Rozwoju, lecz podpisanie takiego dokumentu blokuje prezydent Torunia. Opisana sytuacja ujawnia prawdziwe intencje narzuconego nam odgórnie partnera, gdyż nie chodzi tu o właściwe wykorzystanie środków przyznanych dla całego regionu, ale zawłaszczenie ich w głównej mierze na potrzeby Torunia – pisze Metropolia Bydgoska do ministra Radosława Sikorskiego - Kolejna odsłona tego, co się dzieje wokół ZIT w regionie, to niechlubna postawa marszałka Piotra Całbeckiego, który próbuje zawłaszczyć prawo do rozporządzania środkami adresowanymi do samorządu największego miasta regionu, Bydgoszczy. W minionej perspektywie unijnego  wsparcia finansowego 2007-2013 bydgoszczanie byli świadkami bezprecedensowej marginalizacji ich potrzeb, co wynikało bezpośrednio z  uznaniowości w rozdziale unijnej pomocy przez toruński Urząd Marszałkowski. W rezultacie na statystycznego bydgoszczanina przypadło prawie dwukrotnie mniej unijnego wsparcia niż na mieszkańca sąsiedniego Torunia. 

Stowarzyszenie sugeruje ministrowi - Apelujemy o potraktowanie naszego miasta na równi ze wszystkimi pozostałymi miastami wojewódzkimi Polski i ustanowienie dla niego niezależnego obszaru Zintegrowanych Inwestycji Terytorialnych.